Делян Пеевски е имал допуск и до тайни на НАТО и ЕС. Сертификатите за НАТО и ЕС са му били издадени през 2008 г., съобщи Борис Димитров, председател на Държавната комисия за сигурността на информацията (ДКСИ). Документите вече са прекратени, тъй като е изтекла валидността им. Бързането около номинацията му не е оставило време да се иска подновяването им.
През 2008 г. Пеевски беше зам.-министър на бедствията и авариите. Предишната година той беше уволнен от Сергей Станишев след корупционен скандал, в който беше обвинен за изнудване. Тогава сигналът срещу него беше от директора на "Булгартабак" Христо Лачев, който твърдеше, че Пеевски поискал на близки до него фирми да бъдат осигурени поръчки. Междувременно Пеевски се върна като следовател, след като спечели дело срещу ВСС. Когато прокуратурата прекрати разследването срещу него поради липса на доказателства, той беше възстановен на поста зам.-министър.
Бившият председател на ДКСИ Цвета Маркова обясни пред БНТ, че докато е оглавявал ДАНС, Пеевски е могъл да прочете всеки секретен документ, който поиска. За това задължително обаче е оставена следа, посочи тя. Точно преди избирането си Пеевски е получил достъп до най-секретна вътрешнодържавна информация при съмнителна процедура в свръхкратки срокове.